सीबीएचआई अपने तीन प्रशिक्षण केंद्रों के माध्यम से केंद्र/राज्य सरकारों के विभिन्न स्वास्थ्य संस्थानों में कार्यरत अधिकारियों के लिए मेडिकल रिकॉर्ड के रखरखाव और आईसीडी-10/11 और आईसीएफ के कार्यान्वयन पर सेवाकालीन प्रशिक्षण कार्यक्रम आयोजित करता है :
- मेडिकल रिकॉर्ड विभाग एवं प्रशिक्षण केंद्र, पुडुचेरी
- मेडिकल रिकॉर्ड विभाग एवं प्रशिक्षण केंद्र, वीएमएमसी एवं सफदरजंग अस्पताल, नई दिल्ली
- मेडिकल रिकॉर्ड विभाग एवं प्रशिक्षण केंद्र, एबीवीआईएमएस एवं डॉ. आरएमएल अस्पताल, नई दिल्ली
- केंद्रीय चिकित्सा रिकॉर्ड विभाग एवं प्रशिक्षण केंद्र, आरआईएमएस रांची, झारखंड (पायलट आधार पर)
- आरएचएसटीसी खरड़, मोहाली